三、基因工程小鼠的一般简写方式
1.基因敲除
可以分别用加、减号上标来表示 wildtype allele 与 mutant allele:
KO 纯合子 Gene-/-
KO 杂合子 Gene+/-
野生型对照 Gene+/+ 或 WT (wildtype)
2.基因敲入
将敲入的元件写在上标里,例如:
Shh 基因 E177A 点突变杂合子:Shh E177A/+
如果 Shh 基因敲入报告基因或Cre重组酶基因,可以写成 Shh EGFP/+,或者也可以直接写成 Shh-EGFP、Shh-Cre。
3.转基因
一般直接写出表达的基因结构,例如:
Villin promoter 驱动 EGFP 报告基因的转基因小鼠就可以表示为 Vil-EGFP。
4.条件性基因敲除
将 flox 作为上标表示,比如:
CKO 纯合子 Gene flox/flox 或 Gene f/f
CKO 杂合子 Gene flox/+ 或 Gene f/+
如果与广泛表达 Cre 或生殖系表达 Cre 工具鼠交配后获得了全身敲除的小鼠,那么可以按 KO 小鼠的规则来简写。
如果与组织特异性 Cre 小鼠交配,那么可以组合写成:Gene flox/flox;Cre。
如果文章中只用到一种组织特异性 Cre 工具鼠,也可以按 KO 的方式简写,即 Gene -/- 可以表示 flox 纯合子且 Cre 阳性小鼠。
如果有多种不同的 Cre,那么就需要分别表示了。
例如:Tlr5 flox 小鼠分别与小肠上皮细胞(IEC)特异性 Cre(Vil-Cre)、 DC 细胞特异性 Cre(CD11c-Cre)交配的子代中发生基因敲除的纯合子小鼠可以分别表示为 Tlr5 flox/flox;Vil-Cre 和 Tlr5 flox/flox;CD11c-Cre。如果觉得这样写太麻烦,也可以这样表示:Tlr5 ΔIEC 和 Tlr5 ΔDC。
KO 杂合子 Gene+/-
CKO 杂合子 Gene flox/+
我还是没搞懂这两个区别,回去问ai吧