大老板手下的一个老师给我一个模糊的方向，让我去找文献写综述。
倒不是说工作不合理，只是没啥合理的科研。
老师要求力求能发表。
按照这个学校专硕毕业要求，不要求一定article，如果综述能发表离毕业近了一大步。
只是题目相当不靠谱罢了。

文章不多，开干咯

很多文章if不高大概就3-4分的样子
不过鉴于垃圾课题组近几年还没发过sci，也就不要求什么了

明天要去icu轮转了，而且要开始看论文写综述，之前欠的一些科研准备功课包括各种各样的杂物都没准备好，千万不能拖延赶ddl除非想猝死

今天下午晚上可能要干：
1 看一篇文献(article)
2 至少搞清楚其中一张图在讲什么
3 画出流程图
4 zotero各平台同步(主要是平板)
5 把上次师兄打包发给我的数据转存

啊这篇竟然和自噬扯上关系

FSTL1 is a novel inflammatory mediator and plays a crucial role in the regulation of inflammatory cells

你最好是

我对科研的看法就是《学历之死》

只有发疯没有上进

样本量太小了，血清还好，肺组织这个真的……实验组是肺叶切除，对照组直接是遗体捐赠尸检中心

不是这真的和实验变量的疾病有关吗？
垃圾啊啊啊啊啊啊

虽然没有这些病，但是有可能有肺癌啊……

FSTL1flox/+ mice were a generous gift given by

不会吧这个模型的小鼠还是别人送的（难道造模方法？？）

但说来这个右上标是啥意思啊
得查一查，虽然很常见

C57BL/6 mice
好像是某种品系的小鼠（说来这些实验动物全都忘光了）

FSTL1± mice
26号参考文献讲了建模

看了两页就不想看了，平平无奇

After intubation, mice were mechanically ventilated to assess lung function. Using pressure–volume (PV) loops, lung function was measured including total lung capacity (TLC) and lung compliance (chord compliance, Cchord).

就是看到要给小鼠上机所以截一下（以表吐槽）

还要气管造口和插管
应该说幸好我课题是鼻子而不是肺（？？？）

所有关于科研的一切都很劝退

几个小时过去了我还在看这一页

基因敲除小鼠构建及其相关简写方式

一、 Cre-Lox基本原理

Cre（Cre recombinase 重组酶）：最初在P1噬菌体中被发现，特异性识别 loxP 位点，可以对两个 loxP 位点进行催化重组。

LoxP 位点：34个碱基对构成的回文序列，中间间隔的8个碱基对决定了 LoxP 位点的方向（如图1）。两个 LoxP 位点的位置和方向决定了 Cre 重组的方式，包括敲除、反转和易位。

二、Cre-loxP的应用

携带 loxP 的小鼠被称为 Floxed 小鼠，当它与 Cre 小鼠交配后，Cre-Lox 系统开始工作，可以对两个 loxP 位点以内的基因进行重组，进而实现基因敲除、表达等目的。
1. 组织特异性敲除（conditional knockout, cKO）

当组织特异性 Cre 小鼠（具有组织靶向性的 Cre 小鼠品系很多）与 Floxed 小鼠配繁后，两个 loxP 位点位于同一条染色体上，且方向相同。Cre 重组酶可以介导特定组织中两个同向 loxP 位点发生同源重组。致使“Gene X”处序列被删除，如果该序列的删除使得该基因发生移码突变，则达到基因敲除的效果（如图2）。

2. 组织特异性过表达（conditional knockin, cKI）

Floxed 小鼠转入某个基因的编码序列，并在这段编码序列前面插入“LoxP-STOP-LoxP, LSL”元件。因此，该Floxed小鼠并不表达插入的基因；当存在Cre重组酶时，STOP元件被删除，插入基因才会表达。该体系可用于构建基因条件性敲入小鼠模型（如图3）。

三、基因工程小鼠的一般简写方式
1.基因敲除

可以分别用加、减号上标来表示 wildtype allele 与 mutant allele：

KO 纯合子 Gene-/-

KO 杂合子 Gene+/-

野生型对照 Gene+/+ 或 WT (wildtype)
2.基因敲入

将敲入的元件写在上标里，例如：

Shh 基因 E177A 点突变杂合子：Shh E177A/+

如果 Shh 基因敲入报告基因或Cre重组酶基因，可以写成 Shh EGFP/+，或者也可以直接写成 Shh-EGFP、Shh-Cre。
3.转基因

一般直接写出表达的基因结构，例如：

Villin promoter 驱动 EGFP 报告基因的转基因小鼠就可以表示为 Vil-EGFP。
4.条件性基因敲除

将 flox 作为上标表示，比如：

CKO 纯合子 Gene flox/flox 或 Gene f/f

CKO 杂合子 Gene flox/+ 或 Gene f/+

如果与广泛表达 Cre 或生殖系表达 Cre 工具鼠交配后获得了全身敲除的小鼠，那么可以按 KO 小鼠的规则来简写。

如果与组织特异性 Cre 小鼠交配，那么可以组合写成：Gene flox/flox；Cre。

如果文章中只用到一种组织特异性 Cre 工具鼠，也可以按 KO 的方式简写，即 Gene -/- 可以表示 flox 纯合子且 Cre 阳性小鼠。

如果有多种不同的 Cre，那么就需要分别表示了。

例如：Tlr5 flox 小鼠分别与小肠上皮细胞（IEC）特异性 Cre（Vil-Cre）、 DC 细胞特异性 Cre（CD11c-Cre）交配的子代中发生基因敲除的纯合子小鼠可以分别表示为 Tlr5 flox/flox；Vil-Cre 和 Tlr5 flox/flox；CD11c-Cre。如果觉得这样写太麻烦，也可以这样表示：Tlr5 ΔIEC 和 Tlr5 ΔDC。